Siglos atrás vivió aquí un pueblo de Otomíes con influencia Tolteca, sujeto a Teotihuacán y más tarde a los Tepanecas de Azcapozalco. Cuando este pueblo Otomí junto con los aztecas vencieron a los Tepanecas, el emperador Moctezuma I les concedió su independencia junto con el nombre del Tepotzotlán, “Lugar del Jorobado”.
Tepotzotlán fue, sin duda, uno de los centros educativos de mayor relevancia en la Nueva España. Actualmente su antiguo colegio alberga el impresionante Museo Nacional del Virreinato, que imprime a Tepotzotlán su especial atmósfera colonial y cultural.